女方起诉离婚且已分居两年，仍然需要进行调解。

根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条的规定，夫妻一方要求离婚的，人民法院在审理离婚案件时，应当进行调解。这是法律程序的一部分，旨在通过调解的方式，促使夫妻双方和解或者达成离婚协议，以维护婚姻关系的稳定性和严肃性。

虽然分居两年是法院判决离婚的法定事由之一，但法院在判决时仍需综合考虑夫妻感情是否确已破裂，以及是否有其他导致夫妻感情破裂的情形。分居本身并不自动导致离婚，而是作为判断夫妻感情是否破裂的一个参考因素。

因此，即使女方已经起诉离婚且分居两年，法院仍然会进行调解，以尝试挽救婚姻关系或者和平解决离婚问题。如果调解无效，且法院认为夫妻感情确已破裂，才会准予离婚。

所以，如果你正面临这样的情况，建议积极配合法院的调解工作，同时也准备好相关的证据和材料，以证明夫妻感情确已破裂，为可能的离婚诉讼做好准备。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。