民办非企业单位研究院在一般情况下不可以设立子公司。以下是对此结论的详细解释：

1. 民办非企业单位的性质：

   • 民办非企业单位是指企业事业单位、社会团体和其他社会力量以及公民个人利用非国有资产举办的，从事非营利性社会服务活动的社会组织。
   • 研究院作为民办非企业单位的一种，其宗旨和目的通常是为了进行科学研究、提供公共服务等，而非以营利为主要目的。

2. 子公司的设立条件：

   • 子公司是指由母公司投资设立并受其控制，具有独立法人资格的公司。
   • 子公司的设立通常需要满足一定的资本要求、组织架构要求以及符合相关法律法规的规定。

3. 民办非企业单位与子公司设立的不兼容性：

   • 由于民办非企业单位的非营利性质，其通常不具备投资设立子公司的能力和条件。
   • 民办非企业单位的资金和资源主要用于实现其非营利性的宗旨和目的，而非用于投资或营利活动。
   • 因此，民办非企业单位研究院在一般情况下不能设立子公司。

4. 特殊情况下的考虑：

   • 虽然一般情况下不能设立子公司，但在某些特殊情况下，如政策允许、法律另有规定或经过特定审批程序等，民办非企业单位可能获得设立子公司的特殊许可或授权。
   • 然而，这种情况较为罕见，且需严格遵循相关法律法规和政策规定。

综上所述，民办非企业单位研究院在一般情况下不可以设立子公司，这是由其非营利性质和组织架构所决定的。如有特殊需求或疑问，建议咨询相关政府部门或专业机构以获取更准确的指导和帮助。