当离婚案件进行到第二次开庭，而被告选择不出庭时，法院会根据相关法律规定进行处理。以下是对此情况的详细解答：

一、法院的处理方式

1. 缺席判决：

   • 若被告经传票传唤后，无正当理由拒不到庭，或者在未经法庭许可的情况下中途退庭，法院有权进行缺席判决。
   • 缺席判决意味着法院将在被告缺席的情况下，依据原告提交的证据及陈述，结合法律规定对案件进行审理并作出判决。

2. 公告送达与缺席审理：

   • 若被告因下落不明而未到庭，法院一般会采取公告送达的方式。公告期满后，若被告仍未到庭，法院将进行缺席审理。

二、判决的依据与结果

1. 夫妻感情是否破裂：

   • 离婚案件的核心是判断夫妻感情是否确已破裂。即便被告缺席，法院仍会审查原告提交的证据，如双方分居情况、家庭暴力、感情不和的相关事实等，来综合判断夫妻感情状况。

2. 证据的重要性：

   • 原告应提供充足的证据来证明夫妻感情确已破裂，如存在家庭暴力、分居满两年等法定情形。若证据充分，即便被告缺席，法院也可能判决准予离婚。
   • 若证据不足，法院可能判决不准离婚，因为离婚案件涉及人身关系及诸多重要权益，需全面审查双方情况。

3. 财产分割与子女抚养：

   • 关于财产分割和子女抚养等问题，法院会依据查明的事实和法律规定进行裁判。被告的缺席可能会影响这些问题的判定，但法院会尽量做到公正合理。

三、被告缺席的后果与建议

1. 诉讼权利丧失：

   • 被告缺席意味着放弃了答辩、举证、质证等诉讼权利，这可能对被告不利。

2. 增加诉讼结果的不确定性：

   • 被告缺席会增加诉讼结果的不确定性和对其不利的可能性。因此，建议被告尽量按时到庭维护自身权益。

3. 后续问题处理：

   • 若被告缺席导致法院判决离婚，并在财产分割或子女抚养等问题上产生争议，被告可能需要通过其他法律途径来解决这些问题。

综上所述，当离婚案件第二次开庭被告不出庭时，法院会根据法律规定进行缺席判决。判决结果将依据原告提交的证据和法院查明的事实来确定。因此，对于原告来说，提供充足的证据至关重要；而对于被告来说，尽量按时到庭维护自身权益是明智的选择。