在处理涉及自闭症孩子的抚养权问题时，确实需要特别谨慎和细致的考虑。首先，我要明确的是，无论孩子是否患有自闭症，法律上关于抚养权的规定都是基于孩子的最佳利益来考虑的。

核心结论：如果男方不同意将患有自闭症的孩子判给他，法院将会综合考虑多方面因素，包括孩子的意愿（如果其年龄和智力状况允许表达）、双方父母的经济能力、抚养条件、与孩子的情感联系以及是否能提供孩子所需的特殊照顾等，来做出最有利于孩子的判决。

具体分析：

1. 法律原则：抚养权的判决主要依据《民法典》中关于婚姻家庭的相关规定，特别是关于子女抚养的部分。法律强调保护未成年子女的合法权益，确保他们得到适当的抚养和教育。

2. 特殊考虑：对于患有自闭症的孩子，法院在判决时会特别考虑其特殊需求，如医疗、教育、康复等。这意味着，如果男方无法或不愿意提供这些特殊照顾，法院可能会倾向于将抚养权判给能够更好满足孩子需求的一方。

3. 双方条件对比：法院会综合评估双方父母的经济状况、生活环境、教育背景以及与孩子的情感联系。如果男方在这些方面明显不如另一方，或者无法提供孩子所需的稳定生活环境和特殊照顾，那么判决可能会不利于他。

4. 孩子的意愿：如果孩子的年龄和智力状况允许，法院也会考虑他们的意愿。这通常通过专业人士的评估或孩子的直接表达来实现。

5. 协商与调解：在诉讼之前或过程中，双方父母可以尝试通过协商或调解来解决抚养权问题。这有助于减少冲突，保护孩子的利益，并可能达成双方都能接受的解决方案。

法律建议：

• 如果你作为男方不同意将孩子判给你，建议积极准备证据，证明你具备抚养孩子的能力和条件，特别是针对孩子的特殊需求。
• 同时，你也可以考虑寻求专业律师的帮助，了解你的法律权益和可能的诉讼策略。
• 最重要的是，无论结果如何，都要确保孩子的最佳利益得到保护，并尽可能减少对他们的负面影响。

希望这些分析和建议能对你有所帮助。如果你有任何进一步的问题或需要更详细的法律咨询，请随时告诉我。