在有两个男孩，女方表示不要而男方只要一个的情况下，法院的判决会综合考虑多种因素，以最有利于未成年子女的原则进行裁决，并非直接按照男方或女方的意愿来判定。具体来说，法院会从以下几个方面进行考量：
子女的年龄和性别：
- 虽然年龄和性别不是决定性因素，但法院会考虑子女的成长需求和特点。例如，如果两个孩子年龄相差较大，或者其中一个孩子有特殊的健康或教育需求，法院可能会更倾向于将需要更多照顾的孩子判给更有能力和条件的父母一方。
父母的经济状况和抚养能力：
- 法院会评估父母双方的经济状况，包括收入、财产、住房条件等，以确定哪一方更有能力为子女提供稳定的生活环境和良好的教育条件。
- 同时，法院也会考虑父母的抚养意愿和抚养计划，包括是否愿意承担抚养责任、是否有合理的抚养安排等。
子女的意愿和情感依赖：
- 如果子女已经达到一定的年龄和认知能力，法院可能会考虑他们的意愿和情感依赖。例如，如果其中一个孩子明确表示希望与父亲或母亲共同生活，法院可能会尊重孩子的意愿。
父母的行为和道德品质：
- 法院会评估父母双方的行为和道德品质，包括是否有不良嗜好、是否对子女有虐待或遗弃行为等。这些因素都可能影响法院的判决。
在具体案例中：
- 如果男方经济条件较好，有稳定的收入和住房，且能够提供良好的教育和生活环境，同时男方也表现出强烈的抚养意愿和合理的抚养计划，那么法院可能会倾向于将两个孩子中的一个或两个都判给男方抚养。但考虑到女方也表示不要孩子，且如果另一个孩子对女方没有特别的情感依赖或特殊需求，法院更可能将两个孩子都判给男方，或者根据具体情况，如孩子的意愿，判决其中一个孩子归男方抚养，同时确保女方承担相应的抚养费用。
- 然而，如果女方虽然表示不要孩子，但实际上具备抚养能力且能够提供更好的成长环境，或者如果其中一个孩子对女方有特别的情感依赖，法院也可能会考虑将其中一个孩子判给女方抚养。
法律建议：
- 在这种情况下，建议男方和女方都积极与法院沟通，提供详细的证据和材料来支持自己的抚养主张。
- 同时，双方也可以考虑通过协商或调解的方式解决抚养问题，以减少对子女的伤害和冲突。
- 如果无法达成协议，男方可以寻求专业律师的帮助，准备充分的证据和材料，以维护自己和子女的合法权益。
最终，法院的判决将基于最有利于未成年子女的原则进行裁决，确保子女的权益得到最大程度的保护。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。