签了三方协议考上公务员，通常需要支付违约金，但具体金额和是否构成违约需根据协议条款及法律规定来判断。

三方协议是毕业生、用人单位、学校三方在学生毕业后工作中签订的一份用人协议，它明确了三方在毕业生就业工作中的权利和义务。按照教育部的相关规定，三方协议签署以后，违约方需支付违约金，且金额一般不超过5000元。这一规定旨在保护用人单位和毕业生双方的权益，确保就业市场的稳定和有序。

然而，在实际操作中，是否构成违约以及违约金的支付情况还需根据具体的协议条款来确定。如果三方协议中明确规定了考上公务员等情况不属于违约，或者对违约金有特别的约定，那么就需要按照协议条款来执行。

因此，建议你在处理这种情况时，首先仔细查看三方协议的条款，了解其中关于违约和违约金的具体规定。如果协议中没有明确的规定，或者你对条款的理解存在疑问，那么最好及时与签约单位进行沟通，说明你的情况，并协商违约金的支付事宜。

总的来说，虽然考上公务员可能意味着你需要违约三方协议，但具体是否构成违约以及违约金的支付情况还需根据协议条款和法律规定来判断。在处理这种问题时，务必保持谨慎和理性，确保自己的行为合法合规，并尽量与签约单位协商解决，以避免不必要的纠纷。