合同档案的整理通常可以根据不同的需求和标准来进行，但一般来说，合同档案可以以以下几种单位来整理：

1. 按合同性质分类：

• 这种方法是根据合同的类型或性质来进行分类，如买卖合同、租赁合同、服务合同等。进一步地，还可以根据具体的业务需求进行细分，以便更好地管理和查找。

2. 按时间顺序分类：

• 合同也可以按照签订的时间顺序来整理，例如以年度、季度或月份为单位。这样的分类方式有助于快速定位特定时间段内的合同，对于需要按时间线索查找合同的情况特别有用。

3. 按项目名称分类：

• 对于项目周期较长、合同数量多的情况，按项目名称来整理合同档案可能更为合适。这样可以将与同一项目相关的所有合同集中在一起，方便项目管理和合同执行。

在整理合同档案时，还需要注意以下几点：

• 全面收集材料：确保收集到合同从起草到履行完毕的所有相关文件，包括正副本、补充协议、变更通知等。
• 编制唯一编号：为每份合同编制一个唯一的编号，有助于快速识别和查找合同。
• 仔细审核与校对：在整理过程中要仔细审查合同条款的完整性和准确性，确保各方权利义务明确。
• 合理排序与归类：在同一类合同中，可以根据签订时间、项目进度或其他相关因素进行排序和归类。
• 保密性与安全性考量：对涉及商业秘密或个人隐私的合同，要采取严格的保密措施，确保档案的安全存储。

综上所述，合同档案的整理单位可以根据实际情况灵活选择，但无论选择哪种方式，都需要确保档案的完整、准确和安全。同时，定期的检查和更新也是必不可少的，以确保合同档案能够随时反映企业的最新合同状况。