针对您提出的“未批先建，当事人已经补办施工许可的，如何处罚”的问题，以下是根据相关法律法规进行的详细解答：

首先，“未批先建”行为指的是建设单位在未依法取得施工许可证的情况下擅自开工建设，这违反了《中华人民共和国建筑法》等相关法律法规。对于此类违法行为，法律有明确的处罚规定。

一、处罚依据与标准

1. 《中华人民共和国建筑法》：

   • 第六十四条规定，未取得施工许可证擅自施工的，责令改正，对不符合开工条件的责令停止施工，并可处以罚款。

2. 《建设工程质量管理条例》：

   • 第五十七条也规定，对未取得施工许可证擅自施工的，责令停止施工，限期改正，并处以工程合同价款1%以上2%以下的罚款；对施工单位则处3万元以下罚款。

二、已经补办施工许可的处理

如果当事人在未批先建后，已经主动补办了施工许可证，那么处理此类情况时会综合考虑以下几点：

1. 主动改正的态度：

   • 当事人主动补办施工许可证，表明其有改正错误的意愿和行动，这通常会被视为一个积极的因素。

2. 违法行为的性质与后果：

   • 处罚时会考虑未批先建行为的性质（如是否涉及重大安全隐患、是否对环境造成严重影响等）以及后果的严重程度。

3. 补办手续的合规性：

   • 当事人补办的施工许可证是否完全符合法律法规的要求，包括是否按照规定的程序和要求进行了申请、审批等。

基于以上考虑，相关部门可能会酌情减轻处罚，但具体处罚结果仍需根据实际情况判断。可能的处罚方式包括但不限于：

• 警告或通报批评；
• 处以一定数额的罚款（可能会低于直接未批先建的罚款标准）；
• 要求当事人进行整改或补救措施，以确保项目符合所有法律法规和政策要求。

三、建议与总结

为了避免类似情况的发生，建议建设单位在项目实施前务必确保所有必要的审批手续齐全，并严格遵守相关法律法规和政策要求。同时，对于已发生的未批先建行为，应尽快咨询专业律师或相关部门，了解具体的补办手续和可能的处罚情况，以便及时采取措施进行整改和补救。

总之，“未批先建”行为是违法的，即使后来补办了施工许可证，也可能面临一定的法律处罚。因此，建设单位应高度重视项目审批手续的重要性，确保项目的合法性与合规性。