针对你提出的“合同纠纷中合同无效但有欠条怎么办”的问题，我可以给你以下明确的答复和建议：
首先，欠条上写“无效合同”不必然导致欠条无效。若欠条内容符合法律规定的欠条要件，如双方真实意思表示、有明确的欠款金额等，即便合同被认定为无效，该欠条仍可能有效。关键要看欠条本身是否具备法定要素，如双方身份信息、欠款事实、欠款金额、还款时间等明确内容。
接下来，我分几种情况详细解释：
欠条要素齐全且自愿签订：
- 如果欠条上双方身份信息明确，欠款事实、金额、还款时间等要素都齐全，且是双方自愿签订的，那么即使合同无效，欠条本身仍然具有法律效力。你可以依据欠条向法院提起诉讼，要求对方履行还款义务。
欠条存在瑕疵但不影响效力：
- 如果欠条在表述上存在瑕疵，但基本要素齐全，且双方对欠条的内容没有异议，那么这些瑕疵通常不会影响欠条的效力。你仍然可以依据欠条主张你的权利。
欠条因重大误解或违反法律而受影响：
- 如果因为“无效合同”的表述导致欠条存在重大误解，或者欠条的内容违反了法律法规的强制性规定，那么其效力可能会受到影响。在这种情况下，你需要通过法律途径来认定欠条的有效性，可能涉及诉讼或仲裁等程序。
法律建议：
- 保留证据：无论合同是否有效，欠条都是重要的证据之一。请确保你妥善保管好欠条原件，以及与之相关的所有证据材料。
- 咨询专业意见：如果你对欠条的有效性或如何追讨欠款存在疑问，建议你咨询专业律师（比如我）的意见。我可以根据你的具体情况提供更详细的法律分析和建议。
- 及时采取行动：如果你决定通过法律途径来维护你的权益，请务必及时采取行动。因为法律程序可能需要一定的时间，而且拖延可能会对你的权益造成不利影响。
希望这些解释和建议能对你有所帮助。如果你还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时告诉我。