控股股东与子公司之间的关联交易并不必然违法，但其合法性和合规性需要根据具体情况来判断。
首先，我们需要明确什么是关联交易。关联交易通常指的是公司与其关联方之间的交易行为，这些关联方可能包括控股股东、实际控制人、董事、监事、高级管理人员及其近亲属等。在公司运营中，关联交易是普遍存在的，但也可能带来利益冲突、不公平交易等问题。
对于控股股东与子公司之间的关联交易，我们需要从以下几个方面进行分析：
交易是否公平、公正：这是判断关联交易是否合法的核心标准。如果交易是在公平、公正的基础上进行的，没有损害公司和其他股东的利益，那么这种关联交易就是合法的。
是否履行了必要的披露和审议程序：根据相关法律法规和公司治理准则，关联交易通常需要履行一定的披露和审议程序。例如，上市公司在进行关联交易时，需要按照相关规定进行信息披露，并可能需要经过股东大会或董事会的审议。如果控股股东与子公司之间的关联交易没有履行这些程序，就可能构成违规。
是否存在利益输送或损害公司利益的行为：控股股东作为公司的实际控制人，有责任维护公司的整体利益。如果控股股东利用其对子公司的控制权，通过关联交易进行利益输送或损害子公司的利益，那么这种行为就是违法的。
综上所述，控股股东与子公司之间的关联交易并不必然违法，但需要遵守相关法律法规和公司治理准则，确保交易的公平、公正和合规性。如果在实际操作中遇到具体问题或疑虑，建议及时咨询专业律师或相关监管机构进行解答和指导。