针对您提出的企业法人打击报复行为由哪个部门认定的问题，我们可以从以下几个方面进行解答：

核心结论：企业法人打击报复行为的认定，通常涉及多个部门，包括但不限于公安机关、检察机关、人民法院以及相关的行政监管部门，具体由哪个部门认定，取决于打击报复行为的具体性质、情节以及可能触犯的法律规定。

1. 如果打击报复行为构成犯罪：

   • 公安机关：负责刑事案件的侦查，如果打击报复行为涉嫌刑事犯罪，如故意伤害、诽谤、恐吓等，公安机关将进行立案侦查，并依法追究犯罪嫌疑人的刑事责任。
   • 检察机关：在公安机关侦查完毕后，检察机关将对案件进行审查起诉，决定是否向法院提起公诉。
   • 人民法院：负责刑事案件的审判，如果检察机关提起公诉，人民法院将依法进行审理，并作出有罪或无罪的判决。

2. 如果打击报复行为不构成犯罪，但违反行政法规或行业规范：

   • 相关行政监管部门：如工商行政部门、劳动监察部门等，将根据其监管职责，对违反行政法规或行业规范的企业法人进行查处，并依法给予行政处罚。

3. 如果打击报复行为引发民事纠纷：

   • 人民法院：作为民事纠纷的裁判机关，人民法院将依法审理因打击报复行为引发的民事案件，如名誉权纠纷、劳动争议等，并作出公正判决。

综上所述，企业法人打击报复行为的认定并非由单一部门负责，而是根据行为的具体性质、情节以及可能触犯的法律规定，由多个部门共同协作完成。如果您或您的企业遭遇了打击报复行为，建议及时向相关部门举报或寻求法律援助，以维护自身合法权益。