在民办学校的校长、法人代表不参与的情况下，董事会做出的决议是否有效，取决于具体的法律法规和学校章程的规定。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律法规的约束：

   • 根据《中华人民共和国民办教育促进法》及其实施条例，民办学校的决策机构通常是由举办者、校长、教职工代表等组成的董事会或理事会。这些法规并未明确规定校长或法人代表必须参与董事会的所有决议，但强调了决策机构的集体决策功能。
   • 若法律法规中未明确规定校长或法人代表的参与是决议有效的必要条件，则他们不参与的情况下，董事会做出的决议仍可能有效，前提是决议符合法律法规的其他要求，如决议程序合法、内容不违反法律法规等。

2. 学校章程的规定：

   • 民办学校的章程是学校的基本法，通常规定了学校的决策机构、决策程序、决策权限等内容。
   • 如果学校章程明确规定校长或法人代表必须参与董事会的决议，或者他们的参与是决议有效的必要条件，那么在他们不参与的情况下，董事会做出的决议将可能无效。
   • 反之，如果学校章程未作出此类规定，或者规定了他们不参与时决议仍可有效的条件，那么董事会做出的决议在符合章程规定的情况下将可能有效。

3. 实际情况的考量：

   • 在实际操作中，民办学校的董事会决议是否有效，还需要考虑决议的具体内容、决策过程是否公开透明、是否损害了学校或师生的合法权益等因素。
   • 如果决议内容合法、决策过程公开透明，且未损害学校或师生的合法权益，那么即使校长或法人代表未参与，决议仍可能被视为有效。

综上所述，民办学校的校长、法人代表不参与的情况下，董事会做出的决议是否有效，需要综合考虑法律法规、学校章程以及实际情况等多个因素。如果对此类问题存在疑问或争议，建议咨询专业律师或相关法律机构进行具体分析和判断。