结论前置：在自然人独资的百分之百有限公司中，如果公司破产了，股东通常不承担无限责任，而是以其出资额为限对公司债务承担责任。

详细分析：

首先，我们要明确“自然人独资百分之百有限公司”这一公司形式。在这种公司中，自然人作为唯一的股东，持有公司百分之百的股权。这种公司形式在法律上通常被视为有限责任公司的一种。

接下来，我们分析公司破产时股东的责任。在有限责任公司中，股东的责任是有限制的，即股东只需要以其出资额为限对公司债务承担责任。这意味着，如果公司破产，股东的损失将限于其投资金额，而不会扩展到其个人财产。

现在，我们来看具体的法律规定。根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，有限责任公司的股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任。这意味着，在自然人独资的百分之百有限公司中，如果公司破产，股东不需要用其个人财产来清偿公司的全部债务，而是仅以其出资额为限。

综上所述，自然人独资的百分之百有限公司破产时，股东通常不承担无限责任，而是以其出资额为限对公司债务承担责任。这是有限责任公司制度的一个重要特征，也是保护股东个人财产免受公司债务影响的重要法律原则。

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