公司变更登记提交资料的申请人不一定是经办人。具体分析如下：

一. 申请人与经办人的区别

1. 申请人：在公司变更登记的过程中，申请人通常指的是代表公司提出变更登记申请的自然人或法人。这个角色可能是公司的法定代表人、股东、董事或其他被授权的人员。
2. 经办人：经办人则是指具体负责办理变更登记手续的人员，他们可能是公司内部的员工，也可能是外部的专业服务机构（如律师事务所、会计师事务所）的代表。经办人负责准备和提交所需的资料，并与登记机关进行沟通。

二. 实际操作中的灵活性

• 在实际操作中，申请人和经办人可以是同一人，也可以是不同的人。例如，公司的法定代表人可以作为申请人提出变更登记申请，而具体的经办工作则可能由公司内部的行政人员或外部的专业服务机构来完成。

三. 法律依据

• 根据《中华人民共和国公司登记管理条例》的相关规定，公司变更登记需要提交一系列的资料，并指定一名代表或者委托的代理人负责办理相关手续。这里的“代表”或“委托的代理人”既可以是申请人本人，也可以是经办人。

综上所述，公司变更登记提交资料的申请人不一定是经办人。他们可以是同一人，也可以是不同的人，具体取决于公司的内部安排和实际情况。我建议在实际操作中，公司应明确申请人和经办人的职责和身份，以确保变更登记手续的顺利进行。如有进一步需要，您可以继续咨询我。