针对医生收受红包两千元的情况，处理方式将严格遵循相关法律法规及医疗行业规范。以下是对此问题的详细解答：

一、基本处理原则

1. 零容忍态度：医疗行业对医生收受红包行为持零容忍态度，无论金额大小，均视为违规行为。

2. 及时退还或上缴：医生在收到红包后，应第一时间退还给患者或其家属。若无法退还，则需在24小时内将红包上缴至医院的纪检监察机构或纠察部门。

二、具体处理流程

1. 退还红包：

   • 若医生能当场拒绝并退还红包，则无需进一步处理。
   • 若未能当场退还，医生需尽快（通常24小时内）将红包退还至患者或其家属，并告知医院纪检监察机构。

2. 上缴红包：

   • 若红包无法退还，医生需将红包上缴至医院纪检监察机构或纠察部门。
   • 纪检监察机构或纠察部门需在五个工作日内通知患者，并将红包款项原路返还或作为医疗经费使用。

3. 纪律处分与行政处罚：

   • 对于延误汇报或不愿上交红包的医生，医院将按照规章制度进行纪律处分。
   • 同时，此事件将报告给承担医师注册的卫生行政部门，由该部门依法进行行政处罚。
   • 根据违规收益额的不同，处罚期限也会有所区别。对于违规收益额在1000元至2000元之间的医生，卫生行政部门通常会要求暂停行业职业活动12个月。

三、法律依据与后果

1. 法律依据：

   • 《中华人民共和国刑法》第三百八十五条规定了受贿罪的定义与处罚。
   • 《中华人民共和国医师法》第五十六条也明确规定了利用职务之便牟取不正当利益的处罚措施。
   • 此外，《医疗机构从业人员行为规范》等也明确禁止收受商业贿赂。

2. 法律后果：

   • 若医生收受红包行为构成受贿罪或非国家工作人员受贿罪，将面临严厉的刑事处罚，包括有期徒刑、拘役、罚金等。
   • 即使不构成犯罪，医生也可能因违规行为受到行政处罚，如暂停执业资格、吊销执照等。

四、合规建议

1. 医疗机构：

   • 应建立完善的红包上缴登记制度，设立专门账户用于管理上缴的红包。
   • 定期开展廉政教育，提高医务人员的职业道德和法律意识。
   • 鼓励患者、同行及社会监督，建立举报奖励机制。

2. 医务人员：

   • 应明确告知患者及家属医院政策要求，拒收任何形式的红包。
   • 若遇到患者强行给予红包的情况，应通过正规渠道反映并寻求帮助。

3. 患者及家属：

   • 应避免以“感谢”为名行贿医生，可通过锦旗、公开表扬等方式表达谢意。
   • 若发现医生有收受红包的行为，应积极向医院或卫生行政部门举报。

综上所述，医生收受红包两千元是严重的违规行为，将受到医院和卫生行政部门的严肃处理。医务人员应坚守职业道德底线，拒收红包，共同营造风清气正的医疗环境。