依据员工手册处理员工是否合法，主要取决于员工手册的合法性和处理员工时依据的具体条款是否恰当。

1. 员工手册的合法性：

   • 员工手册是企业内部的人事制度管理规范，相当于企业内的“法律法规”，其制定、修改或决定应当经过民主程序，即需经过职工代表大会或全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或职工代表平等协商确定，并已向劳动者公示或告知。
   • 员工手册的内容不得违反国家法律、行政法规及政策规定，否则将被视为无效，不能作为企业用工管理的依据。

2. 处理员工的合法性：

   • 如果员工的行为确实严重违反了员工手册中合法有效的规定，且企业有确凿的证据支持，那么企业依据员工手册处理员工（如开除）是合法的。
   • 在处理员工时，企业应当确保所依据的员工手册条款是明确、具体且合法的，避免因为条款模糊或违法而导致处理决定被质疑或撤销。

3. 法律建议：

   • 企业在制定员工手册时，应当注重其合法性和合规性，确保手册内容不违反法律法规，并经过民主程序制定和公示。
   • 在处理员工时，企业应当严格依据员工手册中的合法条款，并确保有充分的证据支持处理决定。
   • 如果员工对处理决定有异议，企业应当积极与员工沟通，解释处理决定的依据和理由，并尽量通过协商解决问题。

综上所述，依据员工手册处理员工是否合法，需要综合考虑员工手册的合法性和处理员工时依据的具体条款是否恰当。如果企业在制定和处理过程中都严格遵循法律法规和民主程序，那么依据员工手册处理员工将是合法的。