个人代替公司付款是否合法，需根据具体情况判断。一般而言，这种行为可能涉及财务会计准则以及支付业务的法律规定。

一. 个人代替公司付款可能违反财务会计准则

公司货款应通过公司账户进行支付，以确保财务的透明度和合规性。如果个人未经公司授权或认可，擅自使用个人账户支付公司货款，这可能违反《会计法》及财务会计准则，甚至可能构成挪用资金的行为。情节严重的，还可能触犯《刑法》中的挪用资金罪。

二. 个人代替公司付款需具备相应资质

依照我国现行法律，只有具备相关业务资质的银行业金融机构或持有《支付业务许可证》的支付机构，才能合法从事代收代付活动。这些机构所从事的支付服务范畴应包含其相应的网络支付、预付卡发行及受理或银行卡收单等业务。个人通常不具备这些资质，因此不能合法地代替公司进行付款。

综上所述，个人代替公司付款在大多数情况下是不合法的，除非个人具备相应的支付业务资质或得到了公司的明确授权。我建议公司在进行财务往来时，应严格遵守财务会计准则和支付业务法律规定，确保财务的合规性和透明度。如有进一步需要，您可以继续咨询我。