一般情况下，行政案件判决已过三年，不能再申请再审。下面我详细解释一下相关的法律规定和特殊情况：
一、一般规定
依据《民事诉讼法》的相关规定，当事人申请再审的时间期限是判决、裁定生效后的六个月内。如果存在一些特殊情况，例如有新的证据足以推翻原判决、裁定，或者原判决、裁定认定事实的主要证据是伪造的等，当事人可以自知道或者应当知道之日起六个月内提出再审申请。
二、特殊情况
虽然一般情况下判决生效超过三年就不能再审，但也存在一些例外情形：
新的证据：如果有新的证据，并且这些新证据足以推翻原判决、裁定，当事人可以在知道或者应当知道这些新证据之日起六个月内提出再审申请。
主要证据伪造：如果原判决、裁定认定事实的主要证据是伪造的，当事人同样可以在知道或者应当知道这一事实之日起六个月内提出再审申请。
法律文书被撤销或变更：如果据以作出原判决、裁定的法律文书被撤销或者变更，也可能导致再审申请的期限不受限制。
三、结论
综上所述，在一般情况下，行政案件判决已过三年，是不能再申请再审的。但如果存在上述特殊情形，并且符合法定条件和程序，当事人仍然有可能提出再审申请。不过，这些特殊情况都需要有严格的证据支持和法定程序，因此建议当事人在考虑再审前，务必咨询专业律师，仔细审查案件情况和相关证据。
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