民事再审案件判决书超过三年，一般情况下当事人将无法通过申诉的方式来寻求救济。以下是对此问题的详细分析：

一、申请再审的时限与条件

1. 一般原则：

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关规定，当事人申请再审应当在判决、裁定发生法律效力后六个月内提出。这是为了确保诉讼程序的及时性和稳定性。

2. 特定情形的延长：

   • 存在以下四种特定情形之一的，当事人可以自知道或者应当知道之日起六个月内提出申请再审：
     • 有新的证据，足以推翻原判决、裁定的；
     • 原判决、裁定认定事实的主要证据是伪造的；
     • 据以作出原判决、裁定的法律文书被撤销或者变更的；
     • 审判人员审理该案件时有贪污受贿，徥私舞弊，枉法裁判行为的。

3. 二年限制：

   • 尽管有上述特定情形可以延长申请再审的期限，但法律同时规定了“自判决、裁定发生法律效力之日起满二年”的不得申请再审的期限。这意味着，即使存在特定情形，如果超过了二年的绝对时效，当事人也将无法通过申请再审的方式寻求救济。

二、向检察院申请检察建议或者抗诉

• 如果当事人错过了申请再审的时机，或者再审申请被法院驳回，仍然有可能通过向人民检察院申请检察建议或者抗诉来维护自己的权益。根据法律规定，当事人在以下情形下可以向人民检察院提出申请：

  • 人民法院驳回再审申请的；
  • 人民法院逾期未对再审申请作出裁定的；
  • 再审判决、裁定有明显错误的。

• 人民检察院将在三个月内进行审查，并决定是否提出检察建议或者抗诉。但值得注意的是，当事人只能向人民检察院申请一次，不得重复申请。且这一途径也受时间限制，并非无期限可申请。

三、其他申诉途径及建议

• 除了上述法定的申诉途径外，当事人还可以通过向法院或相关部门信访等其他方式表达诉求。然而，这些途径并不属于法定的诉讼程序，其处理结果和流程相对缺乏明确的法律规定和保障。

四、实际操作建议

• 及时行使权利：为了确保自己的权益得到有效保障，建议当事人在法律规定的期限内及时行使权利，避免错过申诉时机。
• 准备充分证据：如果决定申请再审或向检察院申请检察建议、抗诉，应准备充分的证据材料，以支持自己的主张。
• 寻求专业帮助：在处理此类法律事务时，建议当事人寻求专业律师的帮助，以确保法律操作的正确性和有效性。

综上所述，民事再审案件判决书超过三年，一般情况下当事人将无法通过申诉的方式来寻求救济。但具体还需根据案件情况和法律规定来判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。