公司章程可以设置高于法定要求的通过比例。详细分析如下：

1. 公司自治权利：

   • 根据《公司法》的相关规定，公司享有广泛的自治权利，可以通过公司章程对公司内部治理事项进行具体规定。这一原则为公司章程设置高于法定要求的通过比例提供了法律依据。

2. 法定要求与自治空间：

   • 《公司法》对于某些事项的通过比例有法定要求，如董事会决议的最低通过比例为过半数（依据《中华人民共和国公司法》第一百一十一条）。然而，这并不意味着公司章程不能设定更高的通过比例。
   • 实际上，《公司法》并未禁止公司章程在法定要求之上设定更高的通过比例，这为公司章程的灵活性提供了空间。

3. 设置高于法定要求的通过比例的意义：

   • 设置高于法定要求的通过比例，如三分之二以上，可以确保决策更具代表性和稳定性，防止个别股东或少数派轻易控制公司决策。
   • 这样的规定也有助于提升公司治理的严谨性和规范性，促进公司的长期稳定发展。

4. 规定的明确性与执行：

   • 公司章程中的这一规定应当明确、具体，确保所有相关方都能清晰理解并遵守。
   • 在实际操作中，必须严格按照公司章程规定的程序进行决策，以确保决策的合法性和有效性。

综上所述，公司章程可以设置高于法定要求的通过比例，这是公司自治权利的重要体现。同时，公司应确保这一规定在公司章程中明确、具体，并在实际操作中得到严格执行。如有进一步需要，您可以继续咨询我。