子公司有法律案件，母公司通常仍然可以注销。但这一操作需要谨慎处理，确保符合相关法律法规，并妥善解决可能涉及的问题。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律层面的独立性：

   • 母公司与子公司各自作为独立的法人主体存在，各自独立承担民事责任。
   • 根据《公司法》的相关规定，母公司注销时，并不以子公司的注销为前提条件。

2. 注销前的考虑因素：

   • 债权债务关系：若母子公司之间存在重大的关联交易或未结清的债权债务，母公司的注销可能会引发问题。因此，在注销前，必须妥善处理好这些关系。
   • 子公司依赖：如果子公司的业务开展依赖于母公司的特定资质或授权，母公司的注销将影响子公司的运营。需先解决子公司业务承接问题。
   • 子公司股权处理：母公司注销前，应妥善安排其持有的子公司股权，如通过股权转让等方式，确保子公司的股权结构稳定。

3. 注销流程：

   • 母公司需按照法定的注销条件，完成清算、清理债权债务关系、通知债权人等法定程序。
   • 成立清算组，负责清理公司财产，编制资产负债表和财产清单，通知、公告债权人。
   • 清算结束后，制作清算报告，报股东会或人民法院确认，并报送公司登记机关申请注销登记。

4. 特殊事项及后续处理：

   • 完成税务注销，结清应纳税款、滞纳金和罚款。
   • 办理银行账户、社保公积金账户的注销手续。
   • 及时办理公章、财务章、营业执照等印章和证照的注销手续。

5. 法律合规风险：

   • 在整个注销过程中，应严格遵守相关法律法规和公司章程的规定，确保程序合法、合规。
   • 如有需要，建议咨询专业的律师，以避免潜在的法律风险。

综上所述，虽然子公司有法律案件，但母公司仍然可以注销，只是需要综合考虑多种因素，并确保注销过程的合法性和合规性。如果你在具体操作中遇到任何问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。