重伤由公安机关的法医部门进行鉴定。具体分析如下：

一. 鉴定部门的确定

1. 公安机关法医部门的职责：在刑事案件中，重伤的鉴定由公安机关的法医部门进行。这是因为公安机关承担刑事案件侦查等工作，其法医部门具备专业医学知识和鉴定能力，能够依据医学标准和鉴定程序准确认定人体损伤程度。因此，由其进行重伤鉴定是合理且专业的。
2. 鉴定结论的重要性：鉴定结论是刑事案件定罪量刑及民事赔偿等的重要依据。例如，在故意伤害罪中，不同的伤情等级对应的刑罚不同。因此，重伤的鉴定结果对于案件的审理和赔偿具有至关重要的意义。

二. 鉴定流程与异议处理

1. 鉴定流程：在司法实践中，公安机关会委托有资质的法医机构或法医进行鉴定，以确保鉴定的科学性和权威性。鉴定人员会综合病历资料、检查报告、受伤部位现状等因素，参照人体损伤程度鉴定标准来确定伤情等级。
2. 异议处理：为保障当事人权益，若对鉴定结论存异议，法律赋予其申请重新鉴定的权利。这可以确保鉴定结果的公正性，避免误判或错判。

综上所述，重伤由公安机关的法医部门进行鉴定。这一规定确保了鉴定的专业性和权威性，同时也保障了当事人的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。