部门规章、行政法规与部门文件在法律体系中具有不同的定位和作用，三者之间存在显著区别。以下是具体的区分方法：

一. 制定主体不同

1. 行政法规：由国务院制定。国务院作为国家最高行政机关，依据宪法和法律，制定行政法规。
2. 部门规章：由国务院各部、委员会、中国人民银行、审计署以及具有行政管理职能的直属机构制定。这些机构根据法律、行政法规、国务院的决定和命令，在本部门的权限范围内制定部门规章。
3. 部门文件：各级行政机关均有权制定规范性文件，因此部门文件可以由各级行政机关制定，包括国务院部门及其下属机构。

二. 法律效力不同

1. 行政法规：其法律效力仅次于宪法和法律，在全国范围内具有普遍的约束力。
2. 部门规章：其法律效力低于行政法规，但高于政府规范性文件，仅在本部门的权限范围内有效。
3. 部门文件：通常属于规范性文件，其法律效力低于部门规章，更低于行政法规。

三. 制定依据与程序差异

1. 行政法规：制定依据是宪法和法律，制定程序严格，包括立项、起草、审查、决定、公布等多个环节。
2. 部门规章：制定依据是法律、行政法规、国务院的决定和命令，制定程序相对简便。
3. 部门文件：其制定依据和程序相对灵活，不像行政法规和部门规章那样有严格的法定要求。

四. 名称及规范内容

1. 行政法规：名称一般称为“条例”，也可以称为“规定”“办法”等，通常对某一方面的行政管理作出比较全面、系统的规定。
2. 部门规章：名称一般称为“规定”“办法”，但不得称为“条例”，更多是针对本部门业务范围内的具体行政管理事项作出规定。
3. 部门文件：名称和形式多种多样，可能包括通知、意见、批复等，内容可能涉及具体的行政管理事项、政策解读、工作指导等。

综上所述，行政法规、部门规章和部门文件在制定主体、法律效力、制定依据与程序以及名称及规范内容等方面均存在明显区别。在实际应用中，应准确区分三者，以确保法律的正确实施和有效执行。如有进一步需要，您可以继续咨询我。