驾驶机动车违反交通信号灯通行是一种严重的交通违法行为，以下是关于此行为的详细扣分标准及相关解析：
一、基本扣分标准
按照《道路交通安全违法行为记分管理办法》的规定，驾驶机动车不按交通信号灯指示通行的，即俗称的“闯红灯”，一次将被扣除6分。这一规定严格明确了驾驶人在行车过程中必须严格遵守交通信号灯指示，以确保道路交通的安全与秩序。
二、可能伴随的罚款
除了扣分之外，根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，违反交通信号灯通行的驾驶人还将面临警告或20元以上200元以下的罚款。具体罚款数额由各地根据实际情况自行确定，以确保处罚的公正性和合理性。
三、特殊情况下的处理
虽然闯红灯一般情况下会被扣分和罚款，但在以下特殊情况下，经核实后可能会撤销处罚或免于处罚：
被大型车辆遮挡视线：如果前方有大型车辆（如公交车）遮挡，导致后车驾驶人无法清晰观察信号灯而误闯红灯，可以向交警部门申诉，并提供相关证据。经核实后，处罚有可能会被撤销。
紧急避险情况：在为了避让执行紧急任务的警车、消防车、救护车等特种车辆，或者为了送突发疾病的人员去医院等紧急情况下而闯红灯，只要提供相关证据并经过核实，也有可能免予处罚。
交通信号故障：当信号灯出现故障，如两个方向同时亮绿灯或红灯等异常情况时，如果因此闯红灯，并且能够提供证据证明信号灯确实存在故障，那么一般不会被认定为违法。
交警指挥与信号灯不一致：在有交警现场指挥交通的路口，驾驶人应优先遵循交警的指挥。如果交警的指挥与信号灯指示不一致，导致驾驶人闯红灯，这种情况下也不会受到处罚。
四、注意事项与申诉流程
驾驶人应严格遵守交通规则，确保行车安全。在遇到特殊情况时，应了解相关法律法规，以便合理维护自己的合法权益。
如果对闯红灯的处罚有异议，建议及时向当地交警部门提出申诉，并提供充分的证据来支持自己的主张。申诉时应保持冷静和理性，尊重执法人员的判断，并通过合法途径维护自己的权益。
综上所述，驾驶机动车时务必严格遵守交通信号灯指示，以确保道路交通的安全、有序和畅通。同时，在遇到特殊情况时也应了解相关法律法规和申诉流程，以便合理维护自己的合法权益。