平行分包总包配合费通常由分包单位出。以下是对此问题的详细分析：

一. 总包配合费的性质与目的

• 总包配合费是在建筑工程平行分包的情况下，由总包单位向分包单位收取的一定费用。
• 其目的是用于补偿总包单位在协调、管理、配合分包单位施工过程中所产生的额外成本。

二. 费用承担者的确定

• 根据行业惯例和实际操作，总包配合费通常由分包单位承担。
• 分包单位作为实际受益者，通过支付配合费来获得总包单位的协调、管理和配合服务，从而确保分包工程的顺利进行。

三. 法律依据的间接支持

• 虽然《中华人民共和国建筑法》第二十四条并未直接规定总包配合费的承担者，但该法条提倡对建筑工程实行总承包，并明确了发包单位可以将建筑工程的不同部分发包给一个或多个承包单位。
• 在平行分包的情况下，分包单位与总包单位之间形成了一定的合作关系。为了维护这种合作关系的稳定性和顺畅性，分包单位支付总包配合费是符合行业惯例和实际操作的做法。

四. 实际操作中的注意事项

• 总包配合费的收取标准和方式应在分包合同中明确约定，以避免后续产生争议。
• 分包单位在支付总包配合费后，有权要求总包单位提供相应的协调、管理和配合服务，并确保分包工程的顺利进行。

综上所述，平行分包总包配合费通常由分包单位出。这是基于行业惯例和实际操作的做法，也是确保分包工程顺利进行的重要保障。如有进一步需要，您可以继续咨询我。