对于“国九条重大违法退市要赔偿是否有法律依据”的问题，答案是肯定的。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律依据明确：

   • 新“国九条”明确要求“健全退市过程中投资者赔偿救济机制”，这为投资者在上市公司因重大违法行为退市时寻求赔偿提供了政策依据。
   • 证券法、民事诉讼法等法律法规以及最高人民法院的相关司法解释，也对证券民事损害赔偿的制度机制做出了一系列规定，为投资者维权提供了法律保障。

2. 赔偿前提条件：

   • 上市公司及相关主体存在财务造假、欺诈发行等违法违规行为，是投资者赔偿的前提条件。
   • 对于存在过错的责任主体，投资者可以依法通过起诉、调解、仲裁等法律渠道维护自身权利。

3. 赔偿与退市的关系：

   • 退市本身不产生赔偿义务，但退市过程中的违法违规行为可能导致赔偿责任。
   • 上市公司退市与投资者损害赔偿之间是相互独立的关系，退市不必然导致相关主体承担向投资者赔偿的责任，关键在于是否存在违法或违约行为。

4. 赔偿救济机制：

   • 在现行法律制度框架下，投资者可以通过多种渠道寻求赔偿，包括诉讼、仲裁、调解等。
   • 近年来，证监会等监管机构也在积极推动建立多元纠纷化解机制，以更好地保护投资者的合法权益。

综上所述，国九条重大违法退市要赔偿是有明确的法律依据的。投资者在上市公司因重大违法行为退市且自身权益受到损害时，可以依法通过相关法律渠道寻求赔偿。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。