关于企业使用磷化铝熏蒸中药材是否会面临罚款的问题，这主要取决于具体的使用情况以及相关的法规规定。以下是对这一问题的详细解答：

首先，磷化铝作为一种熏蒸剂，在农业和仓储领域有广泛的应用，但其使用必须严格遵守国家的相关法规和标准。对于中药材的熏蒸处理，同样需要遵循特定的规定，以确保药材的安全性和有效性。

如果企业未按照法规要求使用磷化铝熏蒸中药材，或者使用的磷化铝数量超过了规定的限制，那么确实有可能面临罚款。具体来说，药监部门会根据违规的严重程度和经营的数量来决定处罚的力度。如你所述，最少处罚可能为5000元，而数量越大，处罚则可能越严重。

为了避免不必要的罚款和风险，企业在使用磷化铝熏蒸中药材时，应该做到以下几点：

1. 了解并遵守相关法规：企业需要深入了解国家关于磷化铝使用和中药材处理的相关法规，确保所有操作都在法规允许的范围内进行。
2. 严格控制使用量：按照规定的剂量和使用方法使用磷化铝，避免过量使用导致药材受到污染或产生安全隐患。
3. 做好记录和报告：对磷化铝的使用情况进行详细记录，并按时向相关部门报告，以便监管部门进行监督和检查。
4. 加强员工培训：确保所有参与磷化铝使用的员工都经过专业的培训，了解正确的使用方法和安全注意事项。

总之，企业使用磷化铝熏蒸中药材时，必须严格遵守国家法规和标准，确保操作合规、安全、有效。如果违规使用，确实有可能面临罚款等处罚措施。因此，建议企业在使用前充分了解相关法规，并严格按照规定进行操作。