判决书认定的无效合同是自始无效的。一旦法院作出确认合同无效的判决，该判决就具备了既判力，对合同双方以及相关利害关系人都有约束力。这意味着，合同自始就不具有法律效力，双方当事人无需再履行合同约定的义务。同时，因合同取得的财产应当予以返还或折价补偿；有过错的一方还应当赔偿对方因此所受到的损失。

具体来说：

1. 判决结果的有效性：法院对合同的效力进行审查后，如果认定合同无效，这一判决结果是具有法律效力的。它确认了合同从订立时起就无效，对双方都不再具有约束力。

2. 合同无效后的处理：根据《民法典》的相关规定，合同无效后，行为人因该行为取得的财产，应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方由此所受到的损失；各方都有过错的，应当各自承担相应的责任。

3. 判决的约束力与执行：确认合同无效的判决对双方都有约束力，必须履行。如果一方不履行判决，另一方可以向法院申请强制执行，以确保判决得到落实，维护法律的权威性和当事人的合法权益。

综上所述，判决书认定的无效合同是无效的，双方应当依据判决来处理后续事宜。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。