反垄断执法与行政处罚存在的主要问题包括长期不作为或拖延执法、执法周期过长、部分案件长期悬而未决或疑似烂尾，以及罚款计算基数和没收违法所得的不规范。以下是对这些问题的详细分析：

一. 长期不作为或拖延执法

• 反垄断执法机构在某些情况下可能存在长期不作为或拖延执法的问题，例如对互联网行业涉及VIE架构的经营者未依法申报就实施的经营者集中，执法机构可能未能及时采取行动。这种不作为或拖延不仅损害了市场竞争秩序，也可能导致违法行为持续存在并扩大其负面影响。

二. 执法周期过长

• 部分反垄断案件的执法周期过长，甚至超过4年。长时间的执法过程不仅增加了执法成本，也可能导致证据灭失、当事人权益受损等问题。此外，过长的执法周期还可能影响执法机构的公信力，降低社会对反垄断执法的信任度。

三. 部分案件长期悬而未决或疑似烂尾

• 一些反垄断案件在调查或处理后长期悬而未决，或疑似烂尾，未能给出明确的处理结果。这不仅让当事人处于不确定的状态，也可能引发社会对反垄断执法机构处理能力的质疑。

四. 罚款计算基数和没收违法所得的不规范

• 在反垄断执法中，罚款计算基数和没收违法所得的处理往往存在不规范的情况。例如，部分案件在计算罚款时未能按照集团母公司的销售额作为罚款基数，导致罚款金额偏低；同时，大量案件未能没收违法所得，这降低了反垄断执法的威慑力。

针对上述问题，我建议反垄断执法机构应加强对执法人员的培训和监督，提高执法效率和质量；同时，应完善相关法律法规和执法程序，确保反垄断执法的公正性和透明度。此外，还应加强与社会各界的沟通和合作，共同维护市场竞争秩序和消费者权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。