应立即联系银行核实并申请退还已扣款项，同时与贷款机构沟通协商后续的还款安排。以下是针对您问题的详细分析：

一. 核实扣款情况并申请退还

1. 核实扣款：首先，您需要立即查看银行流水记录，确认扣款的来源和去向，确保扣款确实是由贷款机构发起的。
2. 申请退还：若确认扣款无误，但您因资金不足仅偿还了部分款项（2千元），应立即联系银行或贷款机构，说明情况并申请退还已扣但不足以覆盖全额还款的部分。银行或贷款机构可能会根据具体情况提供相应的解决方案。

二. 与贷款机构沟通协商

1. 了解合同条款：仔细阅读贷款合同，了解关于还款、违约金、逾期罚息等条款的具体内容。这将有助于您更好地与贷款机构沟通协商。
2. 表达还款意愿：向贷款机构表达您的还款意愿，并说明当前的经济状况和还款困难。争取贷款机构的理解和支持，看是否可以宽展还款期间或分期归还剩余款项。
3. 协商解决方案：与贷款机构协商制定新的还款计划，根据自身实际收入情况确定合理的还款金额和周期。例如，可以协商将剩余的2千元欠款分摊到后续的还款周期中逐步偿还。

三. 注意事项

1. 避免逾期：尽管当前资金紧张，但应尽量避免逾期还款。因为逾期还款将产生额外的逾期利息和违约金，进一步加重您的经济负担。
2. 保持沟通：在整个过程中，与贷款机构保持积极沟通至关重要。及时告知您的还款进度和遇到的困难，寻求贷款机构的帮助和支持。
3. 寻求专业帮助：如果与贷款机构的沟通协商无果，或者遇到其他法律纠纷问题，您可以考虑寻求专业的法律援助。

我的观点：面对贷款还款困难时，最重要的是保持冷静并与贷款机构保持积极沟通。通过协商制定合理的还款计划是解决问题的关键。同时，也要关注个人的信用记录避免逾期还款对个人信用造成损害。如有进一步需要，您可以继续咨询我。