如果摩托车在交通事故中承担次要责任，那么确实需要按照责任比例赔付你车的部分损失。具体来说：

1. 赔偿责任比例：

   • 在交通事故中，若摩托车承担次要责任，其赔偿责任比例通常在30%左右。这意味着，对于你的车辆损失，摩托车一方需要承担大约30%的赔偿责任。

2. 赔偿流程：

   • 首先，会由摩托车一方的交强险在赔偿限额内（医疗费1.8万元、财产损失2000元）进行赔付。
   • 超出交强险赔偿限额的部分，再按照责任比例由双方分担。即摩托车一方按其30%的责任比例承担相应份额。

3. 实例说明：

   • 假设你的车辆损失总额为10万元，摩托车一方承担30%的责任，那么摩托车一方需要赔付你3万元。其中，如果摩托车一方的交强险能够覆盖2000元的财产损失，那么剩余的2.8万元将按照责任比例分摊，摩托车一方实际赔付你2.8万元的30%，即8400元，加上交强险的2000元，总计赔付你10400元。

4. 特殊情况：

   • 如果摩托车一方没有购买交强险，那么他需要在本应由交强险赔付的限额内自行承担赔偿责任，然后再按照责任比例分担超出部分的损失。

综上所述，摩托车在交通事故中承担次要责任时，确实需要按照责任比例赔付你车的部分损失。具体的赔偿金额和流程会根据实际情况有所不同，但大致遵循上述原则。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。