针对船员以工资拖欠为由拒绝船舶航行指令的处罚问题，我们可以从以下几个方面进行分析：
核心结论
船员以工资拖欠为由拒绝船舶航行指令，可能面临不同的法律后果，具体取决于事件的性质、情节以及相关法律法规的适用。一般情况下，船员应首先通过合法途径解决工资拖欠问题，而不是直接拒绝航行指令。若拒绝航行指令构成严重违反劳动纪律或船舶管理规定，船员可能会受到相应的纪律处分或法律处罚。
法律分析
工资拖欠的法律责任：
- 按照《中华人民共和国劳动法》第五十条规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
- 用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资的，由劳动行政部门责令其支付劳动者工资和经济补偿，并可责令其支付赔偿金。
船员拒绝航行指令的性质：
- 船员拒绝航行指令可能被视为违反劳动纪律或船舶管理规定的行为。
- 如果拒绝航行指令导致船舶无法正常运营或造成其他严重后果，船员可能需要承担相应的法律责任。
法律建议：
- 船员在面临工资拖欠问题时，应首先通过合法途径（如向劳动行政部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼）来维护自己的合法权益。
- 在采取任何行动之前，船员应仔细考虑其行为可能带来的法律后果，并咨询专业律师的意见。
- 船员应遵守劳动纪律和船舶管理规定，避免采取过激行为或违法行为来解决问题。
特殊情况说明
- 如果船员拒绝航行指令是因为船舶存在安全隐患或违反法律法规的航行指令，那么船员的行为可能被视为正当的自我保护行为，而不是违反劳动纪律或船舶管理规定的行为。在这种情况下，船员应尽快向相关部门报告并寻求帮助。
综上所述，船员以工资拖欠为由拒绝船舶航行指令的处罚问题涉及多个方面，包括工资拖欠的法律责任、船员拒绝航行指令的性质以及法律建议等。船员在面临此类问题时，应谨慎处理并咨询专业律师的意见。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。