父亲与女儿共同创建了独立的两家有限公司后分家，主要适用《公司法》中关于公司分立、股权转让、公司解散与清算等相关规定。下面我将对此进行详细分析：

一. 公司分立

1. 定义与程序：公司分立是指一个公司通过依法定程序分立为两个或两个以上公司的法律行为。根据《公司法》的规定，公司分立必须经过股东会决议，并编制资产负债表及财产清单，同时通知债权人并在规定时间内进行公告。
2. 法律后果：公司分立后，原公司的财产、权利和义务由分立后的公司承继。如果分立前公司与债权人就债务清偿达成的书面协议另有约定的，从其约定。

二. 股权转让

1. 内部转让：如果父亲和女儿作为股东，希望将各自在公司的股权转让给对方或其他股东，这涉及股权转让的法律规定。根据《公司法》，有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。
2. 外部转让：若股权转让给股东以外的第三人，则需经过其他股东过半数同意，并保障其他股东的优先购买权。

三. 公司解散与清算

1. 解散原因：如果双方决定不再继续经营其中一家公司或两家公司都解散，可以根据《公司法》的规定进行公司解散。解散原因可能包括股东会决议解散、公司章程规定的营业期限届满等。
2. 清算程序：公司解散后，应进行清算，清偿公司债务，分配剩余财产。清算组由股东组成，或按照公司章程的规定或股东会的决议产生。

四. 税务与工商变更

1. 税务处理：公司分立、股权转让或解散清算过程中，都涉及税务处理，需按照税法规定申报纳税。
2. 工商变更：相关变更需向工商行政管理部门办理登记手续，包括公司分立后的新公司设立登记、股权转让后的股东变更登记以及公司解散后的注销登记。

我的观点：父亲与女儿共同创建的两家有限公司分家，具体适用哪部法律或哪些条款，取决于他们分家的具体方式和目的。如果是公司分立，则主要适用《公司法》中关于公司分立的规定；如果是股权转让，则适用股权转让的相关规定；如果是公司解散清算，则适用解散清算的法律规定。建议他们在分家前，详细咨询专业律师，确保整个过程的合法性和合规性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。