两个机构的亲子鉴定结果不一定一样。亲子鉴定的结果受到多种因素的影响，包括实验室的技术设备与标准、样本的采集与处理、数据分析与解读以及法律和伦理因素。以下是对这些影响因素的详细分析：

一. 实验室的技术设备与标准

1. 技术差异：不同的亲子鉴定机构可能采用不同的技术设备和实验标准。高质量的设备和严格的操作规程能够提高鉴定结果的准确性和可靠性。如果两家机构都使用先进的设备，并遵循相同的国际标准，得到一致结果的可能性就会增加。然而，如果其中一家机构的设备较旧或操作不规范，结果可能会有所偏差。

2. STR和SNP分析：亲子鉴定通常采用的技术包括STR（短串联重复序列）分析和SNP（单核苷酸多态性）分析。这些技术能够准确识别出个体间的遗传差异。但不同的技术在细节处理上可能存在差异，从而影响最终结果。

二. 样本的采集与处理

1. 样本质量：样本的质量和采集方法直接关系到DNA的完整性和可用性。如果两家机构在样本采集时采用了不同的方法，或者样本在运输和存储过程中受到污染，结果可能会有所不同。

2. 样本类型：亲子鉴定可以通过血液、口腔拭子、毛发等多种样本进行。不同样本类型中的DNA含量和质量可能存在差异，从而影响鉴定结果。

三. 数据分析与解读

1. 算法和软件：不同的实验室在数据分析和解读上可能会使用不同的算法和软件。这些差异可能导致对同一组数据的解读结果不同。

2. 主观因素：结果的解读也可能受到实验人员的主观因素影响。即使面对相同的数据，不同的鉴定专家可能得出不同的结论。

四. 法律和伦理因素

1. 法律规定：不同国家和地区对亲子鉴定的法律规定不同。在某些情况下，甚至同一机构在不同时间对同一样本的鉴定结果也会有所不同。这种法律和伦理背景的差异可能会影响结果的认可程度。

2. 隐私保护：亲子鉴定涉及个人隐私，因此在处理鉴定结果时需要严格遵守相关法律法规和伦理规范。不同机构在隐私保护方面的做法可能存在差异，从而影响结果的公开和接受度。

综上所述，两个机构的亲子鉴定结果不一定一样。为确保结果的准确性和可靠性，建议选择信誉良好、技术先进的实验室进行检测。同时，如果对鉴定结果存在疑问或争议，可以考虑寻求法律途径解决争议或重新选择权威机构进行鉴定。

我的建议：在选择亲子鉴定机构时，应仔细了解其技术设备、实验标准、样本采集和处理流程以及数据分析和解读方法等方面的信息。如有进一步需要，您可以继续咨询我。