夫妻双方只有一本结婚证，在法律上仍然可以证明婚姻关系，但可能在一些事务办理中存在不足。具体分析如下：

1. 结婚证的法律效力：

   • 在中国，结婚证是夫妻关系的法定证明，一般需有两本，一本由婚姻登记机关留存，另一本发给夫妻双方。
   • 只要结婚证是依法登记领取的，即使只有一本，其法律效力仍然有效，可以证明夫妻双方的婚姻关系。

2. 一本结婚证可能带来的问题：

   • 在办理一些涉及婚姻关系的事务时，如房产过户、户口迁移等，可能会要求提供两本结婚证作为证明。此时，仅有一本结婚证可能会导致办理过程受阻或需要额外的证明材料。
   • 若结婚证遗失或损坏，建议及时补办，以避免后续可能出现的法律问题和办事麻烦。

3. 补办结婚证的流程：

   • 若因某些原因需要补办结婚证，夫妻双方可以一同前往原办理结婚登记的婚姻登记机关，或一方常住户口所在地的婚姻登记机关提出申请。
   • 补办时需准备相关材料，如双方身份证、户口本原件及复印件，以及能证明夫妻关系的相关材料（如结婚登记档案复印件等）。
   • 婚姻登记机关会对当事人提交的证件、证明材料进行审查，符合补领条件的，会当场补发结婚证。

综上所述，虽然夫妻双方只有一本结婚证在法律上仍然有效，但为了避免在办理一些事务时的不便，建议尽快补办缺失的结婚证。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。