因甲方原因未备案导致项目无法消案，项目经理应首先与甲方沟通解决备案问题，若沟通无果，可考虑通过法律途径维护自身权益。具体分析如下：

一. 沟通解决

1. 与甲方协商：项目经理应首先与甲方进行沟通，了解未备案的具体原因，并催促甲方尽快完成备案手续。这通常是解决此类问题的最直接和有效的方式。
2. 明确责任：在沟通过程中，应明确双方的责任和义务，特别是关于备案的相关约定，以确保后续处理有明确的法律依据。

二. 法律途径

1. 依据合同条款：如果施工合同中明确规定了甲方应负责备案的相关条款，项目经理可以依据《中华人民共和国民法典》第四百六十五条的规定，要求甲方履行合同义务。若甲方拒不履行，可以考虑通过诉讼或仲裁等方式维护自身权益。
2. 寻求行政干预：根据《建设工程质量管理条例》第四十九条的规定，建设行政主管部门有权对竣工验收过程中违反规定的行为进行责令停止使用，并重新组织竣工验收。因此，如果甲方的不备案行为违反了相关规定，项目经理也可以向建设行政主管部门反映情况，寻求行政干预。

三. 消案处理

1. 备案完成后消案：在甲方完成备案手续后，项目经理应按照相关规定和程序进行消案处理，确保项目的合法性和完整性。
2. 注意保留证据：在整个过程中，项目经理应注意保留相关证据，如沟通记录、合同文本、备案文件等，以备不时之需。

我建议项目经理在处理此类问题时，应首先尝试通过沟通解决，明确双方责任和义务。如果沟通无果，应及时咨询专业律师，了解自身权益和可行的法律途径。同时，注意保留相关证据，以备后续使用。如有进一步需要，您可以继续咨询我。