债权人保全债务人的被代持股权是有效的。以下是对此问题的详细分析：

一. 法律依据

1. 《中华人民共和国民事诉讼法》相关规定：根据该法第一百零一条，利害关系人在情况紧急时，可在提起诉讼或申请仲裁前向人民法院申请采取保全措施，以保护其合法权益不受难以弥补的损害。此条款为债权人申请保全提供了法律依据，无论债务人的股权是否为代持，只要符合保全条件，均可申请保全。

2. 《最高人民法院关于适用《中华人民共和国公司法》若干问题的规定（三）》：该规定第二十四条明确了实际出资人与名义出资人之间代持股权的合法性，并规定了相关权益的归属。这表明，代持股权在法律上是被认可的，因此，债权人对债务人的被代持股权进行保全也是合法的。

二. 保全条件与程序

对于债权人对债务人的被代持股权进行保全，同样需要满足保全的一般条件，即情况紧急，不立即申请保全将会导致债权人的合法权益受到难以弥补的损害，并且债权人需向法院提供充分的证据材料以证明其债权的存在以及保全的必要性。保全程序则按照《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定进行。

三. 保全措施的执行

在保全措施的执行过程中，法院将向股权所在公司及工商局发出协助执行通知，对债务人的被代持股权进行冻结，限制其转让、出质等处分行为。同时，被保全的股权所产生的股息、红利等收益也将被禁止支付给债务人。相关企业需配合法院的保全措施，不得办理被冻结股权的转移手续或向债务人支付相关收益。

四. 特殊情况处理

对于隐名股权的保全，虽然债权人通常无权直接查封，但在特定情况下，如申请执行人提供了隐名投资者的投资状况，债权人可通过行使代位权等方式实现其债权。在此情况下，对债务人的被代持股权进行保全也是有效的。

总结：综上所述，债权人保全债务人的被代持股权是有效的。在实际操作中，债权人应充分了解相关法律法规及保全程序，确保在符合法定条件的前提下提出保全申请，并配合法院完成保全措施的执行。