关于男方是军人，女方想要离婚时应在哪个法院起诉的问题，这主要取决于双方的具体身份和实际情况。以下是根据相关法律法规进行的详细分析：

1. 若女方为非军人：

   • 在这种情况下，若男方（军人）作为被告，女方作为原告提起离婚诉讼，根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》的相关规定，案件应由被告（女方）的住所地人民法院管辖。
   • 若女方的住所地与经常居住地不一致，则由经常居住地人民法院管辖。这里的“住所地”指的是女方的户籍所在地，“经常居住地”则是指女方离开住所地至起诉时已连续居住一年以上的地方。

2. 若夫妻双方均为军人：

   • 当夫妻双方都是军人时，离婚诉讼的管辖法院则有所不同。根据相关规定，这类案件应由军事法院管辖，或者由被告所在的团级以上单位驻地的人民法院管辖。

综上所述，女方在起诉离婚时，应根据自己和男方的具体身份及实际情况来选择正确的管辖法院。若女方为非军人，通常应向被告（女方自己）的住所地或经常居住地的地方人民法院提起诉讼；若夫妻双方均为军人，则应向军事法院或被告所在的团级以上单位驻地的人民法院提起诉讼。

希望以上分析能对您有所帮助。如有其他法律问题或需要进一步的法律指导，请随时向我咨询。