货物被扣押主要发生在行政机关依法监管、司法机关侦查办案，以及其他特殊情况如国家安全机关执行任务时。具体情形分析如下：

一. 行政机关依法实施的扣押

1. 行政执法中的扣押：行政机关在履行监管职责时，若发现货物涉嫌违法，如假冒伪劣、违规进出口等，为制止违法行为、防止证据损毁，可对涉嫌违法的货物实施扣押。例如，市场监管部门在查处销售假冒伪劣商品时，可扣押涉嫌假冒的商品。

• 法律依据：《中华人民共和国行政强制法》第二十二条，明确了行政机关实施扣押的权力、程序及要求。

1. 海关的紧急扣押：海关在履行进出口监管职责时，对走私嫌疑货物或违反海关规定的货物，有权进行扣押。例如，海关检查发现入境货物涉嫌走私，可扣押该货物及运输工具。

• 法律依据：《中华人民共和国海关法》第六条，赋予了海关在特定情形下进行检查、扣押的权力。

二. 司法机关依法实施的扣押

1. 刑事诉讼中的扣押：在刑事案件侦查过程中，若货物与案件有关，如涉及盗窃、走私等犯罪活动，公安机关、人民检察院等司法机关可对货物进行扣押，以收集犯罪证据、查获犯罪嫌疑人。例如，盗窃案件中，警方可扣押藏匿的盗窃所得货物。

• 法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百四十一条，规定了侦查活动中财物的查封、扣押及其程序。

三. 其他特殊情况下的扣押 如国家安全机关在反间谍、反恐工作中，若发现货物与相关活动有关，也可能采取扣押措施。此外，海关在进出口监管中发现的涉嫌违规物品，同样需依法进行扣押。

综上所述，货物被扣押主要发生在行政机关依法监管、司法机关侦查办案，以及其他特殊情况如国家安全机关执行任务时。扣押行为必须严格遵守法律规定和程序要求，确保当事人的合法权益得到充分保障。如有进一步需要，您可以继续咨询我。