律师分别代理母子公司，在某些情况下可能构成利益冲突，但并非绝对。这主要取决于具体案件的事实、律师的职业道德规范以及相关法律法规的规定。

1. 利益冲突的定义：

   • 利益冲突通常指的是律师在代理过程中，因个人或其所代理的其他客户的利益，与其当前所代理的客户利益产生冲突，从而可能影响律师的忠诚度和独立性，进而损害客户的合法权益。

2. 母子公司关系的特殊性：

   • 母公司与子公司虽然在法律上是独立的法人实体，但它们之间往往存在紧密的经济联系和控制关系。这种关系的存在，使得律师在代理其中一方时，可能会接触到另一方的商业秘密或其他敏感信息。

3. 利益冲突的判断标准：

   • 律师在代理母子公司时，需要仔细评估是否存在利益冲突。这通常涉及对律师所代理的各方利益进行全面分析，以及考虑律师是否能够保持忠诚度和独立性，而不会因代理其中一方而损害另一方的利益。

4. 可能构成利益冲突的情况：

   • 如果律师在代理母公司时，需要就涉及子公司的重大决策或利益分配问题提供法律意见，而这些决策或分配可能直接损害子公司的利益，那么此时就可能构成利益冲突。
   • 同样，如果律师在代理子公司时，需要就涉及母公司的敏感信息或商业秘密进行披露，而这些信息的披露可能损害母公司的利益，也可能构成利益冲突。

5. 不构成利益冲突的情况：

   • 如果律师在代理母子公司时，能够确保所代理的各方利益不会相互冲突，且律师能够保持忠诚度和独立性，那么此时就不构成利益冲突。
   • 例如，律师可能只是为母公司提供一般性的法律咨询，而不涉及子公司的具体业务；或者律师只是为子公司提供某一特定领域的法律服务，而不涉及母公司的核心利益。

6. 律师的职业道德规范：

   • 律师在代理过程中，应严格遵守职业道德规范，确保不会因个人利益或其他客户的利益而损害当前所代理客户的利益。
   • 如果律师发现存在利益冲突或潜在的利益冲突，应及时向客户披露，并考虑是否需要采取回避措施。

综上所述，律师分别代理母子公司是否构成利益冲突，需要根据具体情况进行判断。如果律师能够确保所代理的各方利益不会相互冲突，且能够保持忠诚度和独立性，那么就可以接受这种代理。但如果存在利益冲突或潜在的利益冲突，律师应及时向客户披露，并考虑采取适当的回避措施。