摩托车超期未上牌，公安机关交通管理部门会扣留机动车，并可以依据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条的规定处警告或者二十元以上二百元以下罚款。具体分析如下：
一. 摩托车超期未上牌属于违法行为
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，机动车上路行驶必须悬挂机动车号牌。摩托车作为机动车的一种，也必须遵守这一规定。因此，摩托车超期未上牌属于违反道路交通安全法律、法规的行为。
二. 处罚措施
- 扣留机动车：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十五条，公安机关交通管理部门对于上道路行驶的未悬挂机动车号牌的摩托车，会采取扣留机动车的措施。
- 罚款：依据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条，对于违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的行为，可以处警告或者二十元以上二百元以下罚款。摩托车超期未上牌属于此类违法行为，因此会受到相应的罚款处罚。
三. 处理流程
- 当事人被扣留机动车后，应当尽快提供相应的牌证或者补办相应手续。一旦当事人提供了相应的牌证或者补办了相应手续，公安机关交通管理部门应当及时退还机动车。
综上所述，摩托车超期未上牌是违反道路交通安全法律、法规的行为，会受到扣留机动车和罚款的处罚。我建议摩托车车主在购车后尽快办理上牌手续，以避免不必要的法律风险和损失。如有进一步需要，您可以继续咨询我。