小区变压器室放在门市房内是否合法，需根据具体情况分析。以下是几个关键角度的考量：

1. 法律法规与规划要求：

   • 通常情况下，变压器室的设置应遵循相关的建筑规范、电气安全规范以及城市规划要求。这些规范往往对变压器室的位置、与居民区的距离、安全防护措施等有明确规定。
   • 如果门市房原本的规划或设计用途中并未包含变压器室，且未经相关部门审批擅自改变用途，那么这种设置可能是不合法的。

2. 安全考虑：

   • 变压器室作为电力设施的一部分，其设置和运营需要确保安全。如果将其放置在门市房内，必须确保符合所有电气安全标准，包括防火、防爆、防触电等。
   • 若门市房的结构、通风、消防等条件无法满足变压器室的安全要求，那么这种设置将存在严重的安全隐患，进而可能是不合法的。

3. 产权与物权关系：

   • 门市房的产权归属和物权关系也是判断合法性的重要因素。如果门市房属于业主共有或存在其他物权纠纷，未经相关权利人同意擅自将变压器室设置于内，可能侵犯了他人的合法权益。

4. 环境影响与居民权益：

   • 变压器室在运行过程中可能会产生噪音、电磁辐射等影响，如果这些影响超出了法定标准或合理范围，对周边居民的生活造成了干扰或损害，那么这种设置也可能被视为不合法。

综上所述，判断小区变压器室放在门市房内是否合法，需要综合考虑法律法规、安全标准、产权关系以及环境影响等多个方面。如果你面临具体情况，建议收集相关证据和材料，咨询当地相关部门或专业律师以获取更准确的法律意见。