银行卡限额1000是否合法，需根据具体情况分析，不能一概而论。

一. 银行卡限额的合法性

1. 银行规定的限额：银行为了风险控制和客户资金安全，通常会对银行卡设置一定的交易限额，包括日交易限额、年交易限额等。如果银行明确规定某类银行卡（如学生卡、未成年卡等）的限额为1000元，那么这种限额是合法的，是银行根据风险管理和业务规则设定的。
2. 法律法规的约束：目前，我国并没有具体的法律法规直接规定银行卡的限额标准。《中华人民共和国个人所得税法》第三条主要规定的是个人所得税的税率，与银行卡限额无直接关联。因此，银行卡限额的合法性主要依据银行的规定和与客户之间的协议。

二. 针对未成年人的特殊考虑

• 对于满16岁未满18岁的未成年人，他们虽然具有一定的民事行为能力，但银行可能会出于风险控制和保护未成年人的考虑，对他们的银行卡设置较低的限额。如果这种限额是银行根据业务规则和风险管理需要设定的，并且符合相关法律法规的要求（如《中华人民共和国未成年人保护法》等），那么这种限额也是合法的。

三. 结论与建议

• 结论：银行卡限额1000元是否合法，主要取决于银行的规定和与客户之间的协议，以及是否符合相关法律法规的要求。如果银行有明确规定，并且这种规定不违反法律法规，那么限额就是合法的。
• 建议：如果您对银行卡限额有疑问或不满，建议直接咨询银行客服或前往银行网点咨询，了解具体的限额规定和申请调整限额的流程。如有进一步需要，您可以继续咨询我。