学校不允许自主实习是否违法，需根据具体情况判断。以下是对此问题的详细分析：
合法情况：
- 教学管理与质量保障：学校有权制定教学计划和实习安排，以确保学生实习能达到教育目标和质量标准。若学校统一联系实习单位，可能是为了监督实习过程，保证实习内容与专业课程紧密结合，提供系统有效的实践锻炼。在这种情况下，学校限制自主实习是行使正常教学管理权限，并不违法。
- 安全保障：学校统一安排实习能评估和控制实习单位的安全性，提供及时的安全指导和保障。出于对学生安全的考虑，限制自主实习在合理范围内是合法的。
- 法律规定：根据《职业学校学生实习管理规定》，学校在学生实习方面享有一定管理权。只要学校规定合理且不违反法律，学生需遵守。
违法情况：
- 强制安排与利益关联：若学校强制学生参加特定实习单位，且与这些单位存在不正当经济利益关联，如获取回扣等，这种行为不仅不合理，还可能违反教育部门相关规定，损害学生权益，构成违法。
- 剥夺自主选择权：根据《职业学校学生实习管理规定》第十四条，学生有权自行选择实习单位，并在实习前将实习协议提交所在职业学校。若学校完全剥夺学生自主实习权利，且缺乏充分合理理由，不给学生提供申诉渠道和解释说明，这种做法可能侵犯学生的合法权益，违背以学生为本的教育理念，构成违法。
综上所述，学校不允许自主实习的行为是否违法，需根据学校的具体规定、实习安排的目的和合理性、以及是否侵犯学生合法权益等因素来判断。若学生认为学校规定不合理或侵犯了自身权益，可与学校进行沟通，或向当地教育主管部门投诉，以维护自身合法权益。