施工合同双方只签一份通常是有效的。合同的成立并不以合同份数为绝对标准，而是要看双方是否就合同的主要条款达成一致，并且双方都在合同上签字或盖章。只要满足这些条件，合同即成立并生效。

然而，也需要注意一些特殊情况。如果双方在合同中明确约定合同需双方各执一份，或者有其他关于合同份数的约定，那么只签一份可能会引发争议。比如，在履行合同过程中，双方对合同内容的理解出现分歧时，缺乏对方持有的合同文本可能会给举证等带来不便。

因此，虽然只签一份合同在法律上通常是有效的，但为了避免可能出现的纠纷，最好还是双方各执一份合同。这样能更清晰地明确双方的权利义务以及合同的具体内容，避免因合同文本缺失而导致的不必要麻烦。

总的来说，施工合同双方只签一份在大多数情况下是有效的，但为了避免潜在风险，建议双方还是各执一份合同为妥。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。