施工许可证与施工单位不一致时，应当重新申请领取施工许可证。下面是对此问题的详细分析：

一. 施工许可证的重要性及办理流程

• 施工许可证是建筑工程开工前必须取得的法定证件，依据《中华人民共和国建筑法》第七条，建筑工程开工前，建设单位需向工程所在地县级以上人民政府建设行政主管部门申请领取施工许可证。
• 办理施工许可证需按照《建筑工程施工许可管理办法（2021年修订本）》第五条规定的程序进行，包括领取申请表、提交证明文件、发证机关审核等步骤。

二. 施工单位变更的影响

• 施工单位作为建筑工程的重要参与方，其资质、能力直接影响工程的质量和进度。
• 若施工许可证上记载的施工单位与实际施工单位不一致，可能引发合同管理、工程质量、安全责任等一系列问题。

三. 法律规定及处理方式

• 根据《建筑工程施工许可管理办法（2021年修订本）》第五条的规定，建筑工程在施工过程中，建设单位或者施工单位发生变更的，应当重新申请领取施工许可证。
• 因此，当施工许可证与施工单位不一致时，为了符合法律法规要求，确保工程合法合规进行，建设单位应当及时重新申请领取施工许可证。

四. 实际操作建议

• 建设单位在发现施工许可证与施工单位不一致时，应立即停止施工，避免可能的法律风险。
• 及时与发证机关沟通，了解重新申请施工许可证的具体流程和要求，准备相关材料并尽快提交申请。
• 在重新申请施工许可证期间，建设单位应做好与施工单位、监理单位等各方的沟通协调工作，确保工程暂停期间的管理和后续施工的顺利进行。

综上所述，施工许可证与施工单位不一致时，必须重新申请领取施工许可证，以确保工程的合法性和合规性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。