违法收购、加工、运输林木的罚款计算中，运输林木价款可以等同运输货款。以下是详细分析：

在《森林法》第七十八条中，对于收购、加工、运输明知是盗伐、滥伐等非法来源的林木的行为，规定了由县级以上人民政府林业主管部门责令停止违法行为，并可以处违法收购、加工、运输林木价款三倍以下的罚款。这里的“林木价款”指的是与非法收购、加工、运输的林木相对应的经济价值，它反映了林木的市场价格或交易价值。

在实际情况中，运输林木的货款通常是根据林木的价款来确定的，即货款是林木价款的直接体现。因此，在计算罚款时，运输林木的货款可以作为林木价款的一个参考依据。如果无法直接确定林木的具体价款，那么运输货款可以作为一个合理的替代指标，用于计算罚款金额。

综上所述，在违法收购、加工、运输林木的罚款计算中，运输林木价款可以等同运输货款来作为计算罚款的依据。这一结论符合《森林法》的相关规定，也体现了法律对非法行为的惩罚性。