交通运输部门不能直接依据消防法对违法行为进行处罚。下面我将从几个方面详细解释这个问题：
法律适用原则：
- 交通运输部门主要负责交通运输领域的监管和执法，其执法依据主要是交通运输相关的法律法规，如《中华人民共和国道路交通安全法》、《中华人民共和国道路运输条例》等。
- 消防法主要规范的是消防安全和消防管理，由消防部门负责执行和监管。因此，交通运输部门在执法过程中，应当严格依照交通运输领域的法律法规进行，而不能直接适用消防法。
执法权限划分：
- 各个行政部门都有其特定的执法范围和权限，这些权限通常通过法律法规进行明确划分。
- 交通运输部门作为专门的行政执法机构，其执法权限被限定在交通运输领域，不能超越这一范围去行使其他部门的执法权。
特殊情况处理：
- 当然，也存在一些特殊情况，比如交通运输过程中发生了火灾事故，这时消防部门可能会介入进行救援和调查。
- 但在这种情况下，消防部门的介入是基于火灾事故本身，而不是基于交通运输部门的执法请求或依据消防法对交通运输违法行为进行处罚。
综上所述，交通运输部门在执法过程中，应当严格依照交通运输领域的法律法规进行，不能直接依据消防法对违法行为进行处罚。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。