妻子的祖父母是表兄妹不会影响你的子女。具体分析如下：

一. 法律规定与亲缘关系分析

1. 亲缘关系界定：根据《中华人民共和国民法典》第一千零四十八条，直系血亲或者三代以内的旁系血亲禁止结婚。这里明确规定了禁止结婚的亲缘范围。

2. 具体案例分析：妻子的祖父母是表兄妹，这意味着妻子的父母是第一代未受影响的后代，妻子是第二代，而你的子女则是第三代。从法律的角度来看，这种亲缘关系已经超出了三代以内的旁系血亲范围，因此不属于法律禁止结婚的情形。

3. 对子女的影响：既然妻子的祖父母的关系并不违反法律禁止结婚的规定，那么这种亲缘关系对你的子女就不会产生法律上的影响。子女的法律地位、权益等都不会因此受到任何损害。

二. 医学与遗传学角度

• 虽然从法律角度来看，妻子的祖父母是表兄妹对你的子女没有影响，但从医学和遗传学角度来看，近亲结婚可能增加某些遗传疾病的风险。然而，这种风险在你们的子女这一代已经大大降低，因为已经隔了多代。

我建议：虽然法律上没有问题，但如果你对家族的遗传病史有担忧，可以考虑进行相关的遗传学咨询或检查，以更全面地了解子女的健康状况。如有进一步需要，您可以继续咨询我。