男方起诉离婚时，孩子的抚养权判决主要依据《中华人民共和国民法典》的相关规定，以及孩子的年龄、父母的抚养能力和抚养条件等因素综合考虑。具体来说：
一、基本判决原则
不满两周岁的子女：
- 以由母亲直接抚养为原则。这是因为婴幼儿对母亲的生理和心理依赖较强，母亲哺乳也更有利于孩子的成长发育。
- 但如果母亲存在患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活，或者因其他原因子女确无法随母方生活的情况，孩子也可随父方生活。
已满两周岁的子女：
- 父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。
- 法院会综合考虑父母双方的经济状况、生活环境、教育背景、照顾子女的时间和精力等因素。例如，一方有稳定且较高的收入，能为孩子提供良好的生活和教育条件；或者子女随一方生活时间较长，改变生活环境对子女健康成长明显不利等，这些都可能成为判决的考量因素。
- 如果一方已做绝育手术或因其他原因丧失生育能力，或者存在其他优先抚养的情形，法院在判决时可能会优先考虑该方。
已满八周岁的子女：
- 应当尊重其真实意愿。这是因为八周岁以上的孩子已经有了一定的自主意识和判断能力，他们的意愿应当得到尊重。
二、其他相关因素
- 孩子的年龄和性别：虽然这不是决定性因素，但法院在判决时也会予以考虑。例如，对于年幼的孩子，母亲可能更适合抚养；而对于青春期的孩子，法院可能会更多地考虑其性别和与父母的沟通情况。
- 特殊情况：如果父母一方存在家暴、虐待子女等不利于孩子成长的行为，法院会依法作出更有利于孩子的判决。
三、判决结果
- 一方抚养：在大多数情况下，法院可能会判决孩子由一方抚养，另一方支付抚养费。抚养费的数额和支付方式可以由双方协商确定，也可以由法院判决。
- 共同抚养：在有利于保护子女利益的前提下，父母双方协议轮流抚养子女的，法院可予准许。但这种情况相对较少，需要双方达成一致意见。
四、注意事项
- 抚养权的变更：如果抚养孩子的一方出现不利于孩子成长的情况，或者另一方有能力更好地抚养孩子，双方可以协商变更抚养权，或者通过诉讼程序请求法院变更抚养权。
- 探视权：离婚后，不直接抚养子女的父或母有探望子女的权利，另一方有协助的义务。这是基于父母子女关系而产生的身份权，任何一方都不能剥夺。
概括来说，男方起诉离婚时孩子的抚养权判决是一个复杂的过程，需要综合考虑多种因素。如果您面临类似的问题，建议咨询专业的律师以获取更具体的法律建议。